Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBSLP0DN79 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms