Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2BP0DI82 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2BP0DI82 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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