Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAPPC2P0DI81 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
TRAPPC2P0DI81 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms