Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEC24DO94855 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms