Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR3AO14802 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR3AO14802 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms