Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GABRPO00591 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GABRPO00591 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GABRPO00591 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRPO00591 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GABRPO00591 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms