Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2K7ER74 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms