Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDHR5-202ENST00000358353 3635 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms