Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF839A8K0R7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF839A8K0R7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms