Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
ARID3CA6NKF2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARID3CA6NKF2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms