Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC162PA2VCL2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms