Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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KCNIP3Q9Y2W7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
KCNIP3Q9Y2W7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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