Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AGAP1Q9UPQ3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms