Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DSEQ9UL01 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DSEQ9UL01 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms