Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1Q9UJ41 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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RABGEF1Q9UJ41 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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RABGEF1Q9UJ41 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RABGEF1Q9UJ41 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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