Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MBD1Q9UIS9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms