Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRPC4Q9UBN4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms