Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC17A6Q9P2U8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC17A6Q9P2U8 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms