Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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USP35Q9P2H5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP35Q9P2H5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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