Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3BP4Q9P0V3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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SH3BP4Q9P0V3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3BP4Q9P0V3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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