Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NKIRAS1Q9NYS0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NKIRAS1Q9NYS0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms