Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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KLHL28Q9NXS3 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL28Q9NXS3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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