Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATAD3AQ9NVI7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms