Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SH2B1Q9NRF2 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.3 ms