Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA4BQ9NPR2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms