Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC17Q9NP64 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms