Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP4F12Q9HCS2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms