Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NRDE2Q9H7Z3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms