Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIPCQ9C0C6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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