Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NLRP1Q9C000 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms