Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TRIM8Q9BZR9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms