Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GORASP1Q9BQQ3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GORASP1Q9BQQ3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms