Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COPS8Q99627 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
COPS8Q99627 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms