Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAT1Q99536 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.1 ms