Protein–RNA interactions for Protein: Q96IQ7

VSIG2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG2Q96IQ7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
VSIG2Q96IQ7 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms