Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RTP4Q96DX8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms