Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP13Q86W25 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP13Q86W25 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms