Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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SNX20Q7Z614 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNX20Q7Z614 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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