Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
APTXQ7Z2E3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
APTXQ7Z2E3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms