Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTN1Q16799 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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RTN1Q16799 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTN1Q16799 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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