Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYPL1Q16563 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYPL1Q16563 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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