Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
ZFHX3Q15911 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ZFHX3Q15911 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms