Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
UBE3CQ15386 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms