Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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CLCA4Q14CN2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLCA4Q14CN2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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