Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TRIM25Q14258 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms