Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LAMB3Q13751 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMB3Q13751 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMB3Q13751 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAMB3Q13751 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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