Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ALCAMQ13740 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
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