Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CUL3Q13618 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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CUL3Q13618 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CUL3Q13618 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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