Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CUL1Q13616 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CUL1Q13616 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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