Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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